La QB implica la aplicación de técnicas químicas, analíticas y la síntesis de moléculas orgánicas. En este contexto, el GEQB se crea en 2011 a propuesta de José Luis Mascareñas y Sonsoles Martín Santamaría para satisfacer la creciente necesidad de representar las áreas de investigación en la frontera entre la química y la biología más convencionales. La primera junta directiva, presidida por José Luis Mascareñas (CIQUS; USC) prepara los estatutos del grupo y diseña las estructuras básicas de actuación. En 2016, la presidencia del grupo pasa a Sonsoles Martín Santamaría, que lo lidera hasta 2019, año en el que Oscar Millet asume la misma. Durante todas estas diferentes etapas el grupo ha crecido y se ha consolidado. En la actualidad (enero 2022) el GEQB cuenta con 234 socios.
Las reuniones bienales del GEQB, sin duda la actividad más importante del grupo, comenzaron en 2012 en Santiago de Compostela y han continuado con éxito en Bilbao, 2014 (conjuntamente con el XIV Encuentro Ibérico de Péptidos), Madrid, 2016 (esta vez junto con el grupo especializado RSEQ en carbohidratos), Barcelona, 2018 (conjuntamente con el XVI Encuentro Ibérico de Péptidos) y Granada en 2020.
La misión del GEQB es la de fomentar la interacción y colaboración científica entre sus miembros, tanto a nivel privado como desde el punto de vista institucional donde, por ejemplo, ya se mantienen relaciones fluidas con los grupos de resonancia magnética nuclear y de carbohidratos, con los que se ha organizando conjuntamente un simposio en la reunión bienal de la RSEQ.
La visión del GEQB es proporcionar un foro innovador y transversal de la química biológica, difiriendo de un enfoque meramente reduccionista e intentando buscar una descripción del holismo del problema científico. A tal fin, el grupo pretende potenciar la investigación multidisciplinar en áreas tan diversas como la química médica, la química supramolecular, la química bioorgánica, la farmacología, la genética, la bioquímica y la ingeniería metabólica entre otras.